Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PDE6GP18545 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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