Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRAP18433 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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