Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCP1P17987 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCP1P17987 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCP1P17987 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCP1P17987 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCP1P17987 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCP1P17987 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCP1P17987 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCP1P17987 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCP1P17987 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCP1P17987 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCP1P17987 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCP1P17987 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCP1P17987 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCP1P17987 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCP1P17987 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCP1P17987 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCP1P17987 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCP1P17987 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCP1P17987 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCP1P17987 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCP1P17987 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCP1P17987 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCP1P17987 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCP1P17987 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCP1P17987 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCP1P17987 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCP1P17987 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCP1P17987 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCP1P17987 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCP1P17987 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCP1P17987 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCP1P17987 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCP1P17987 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCP1P17987 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCP1P17987 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCP1P17987 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCP1P17987 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCP1P17987 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCP1P17987 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCP1P17987 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCP1P17987 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCP1P17987 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCP1P17987 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCP1P17987 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCP1P17987 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCP1P17987 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms