Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms