Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAV1P15498 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAV1P15498 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAV1P15498 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VAV1P15498 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAV1P15498 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAV1P15498 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAV1P15498 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAV1P15498 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAV1P15498 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAV1P15498 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAV1P15498 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAV1P15498 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAV1P15498 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAV1P15498 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAV1P15498 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAV1P15498 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAV1P15498 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAV1P15498 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VAV1P15498 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VAV1P15498 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAV1P15498 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAV1P15498 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAV1P15498 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAV1P15498 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAV1P15498 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VAV1P15498 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAV1P15498 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAV1P15498 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAV1P15498 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAV1P15498 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAV1P15498 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAV1P15498 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAV1P15498 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAV1P15498 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VAV1P15498 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAV1P15498 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms