Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB1P14653 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms