Protein–RNA interactions for Protein: P13987

CD59, CD59 glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD59P13987 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD59P13987 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD59P13987 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD59P13987 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD59P13987 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD59P13987 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD59P13987 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD59P13987 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD59P13987 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD59P13987 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD59P13987 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD59P13987 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD59P13987 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD59P13987 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD59P13987 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD59P13987 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD59P13987 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD59P13987 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD59P13987 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD59P13987 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD59P13987 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CD59P13987 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD59P13987 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD59P13987 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD59P13987 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD59P13987 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD59P13987 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD59P13987 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD59P13987 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD59P13987 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD59P13987 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD59P13987 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD59P13987 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD59P13987 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD59P13987 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD59P13987 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD59P13987 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD59P13987 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD59P13987 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD59P13987 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD59P13987 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD59P13987 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD59P13987 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD59P13987 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD59P13987 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD59P13987 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD59P13987 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD59P13987 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD59P13987 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD59P13987 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD59P13987 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD59P13987 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CD59P13987 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD59P13987 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD59P13987 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD59P13987 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD59P13987 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CD59P13987 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD59P13987 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD59P13987 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD59P13987 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CD59P13987 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD59P13987 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD59P13987 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD59P13987 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CD59P13987 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD59P13987 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD59P13987 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD59P13987 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD59P13987 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD59P13987 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD59P13987 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms