Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCP1P13796 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCP1P13796 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCP1P13796 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCP1P13796 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCP1P13796 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCP1P13796 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCP1P13796 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCP1P13796 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCP1P13796 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCP1P13796 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCP1P13796 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCP1P13796 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCP1P13796 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCP1P13796 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCP1P13796 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCP1P13796 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCP1P13796 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCP1P13796 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCP1P13796 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCP1P13796 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCP1P13796 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCP1P13796 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCP1P13796 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCP1P13796 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCP1P13796 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCP1P13796 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCP1P13796 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCP1P13796 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCP1P13796 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCP1P13796 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCP1P13796 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCP1P13796 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCP1P13796 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LCP1P13796 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LCP1P13796 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCP1P13796 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCP1P13796 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCP1P13796 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LCP1P13796 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCP1P13796 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCP1P13796 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCP1P13796 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCP1P13796 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCP1P13796 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCP1P13796 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCP1P13796 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCP1P13796 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LCP1P13796 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms