Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG2P13727 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRG2P13727 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRG2P13727 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRG2P13727 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRG2P13727 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRG2P13727 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRG2P13727 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRG2P13727 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRG2P13727 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRG2P13727 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRG2P13727 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRG2P13727 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRG2P13727 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRG2P13727 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRG2P13727 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRG2P13727 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRG2P13727 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRG2P13727 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRG2P13727 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRG2P13727 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRG2P13727 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRG2P13727 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRG2P13727 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRG2P13727 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRG2P13727 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRG2P13727 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRG2P13727 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRG2P13727 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRG2P13727 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRG2P13727 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRG2P13727 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRG2P13727 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRG2P13727 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRG2P13727 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRG2P13727 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRG2P13727 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRG2P13727 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms