Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CFTRP13569 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CFTRP13569 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CFTRP13569 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CFTRP13569 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CFTRP13569 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CFTRP13569 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CFTRP13569 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CFTRP13569 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CFTRP13569 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CFTRP13569 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CFTRP13569 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CFTRP13569 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CFTRP13569 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CFTRP13569 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CFTRP13569 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CFTRP13569 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CFTRP13569 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CFTRP13569 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CFTRP13569 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CFTRP13569 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CFTRP13569 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CFTRP13569 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CFTRP13569 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CFTRP13569 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CFTRP13569 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CFTRP13569 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CFTRP13569 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CFTRP13569 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CFTRP13569 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CFTRP13569 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CFTRP13569 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CFTRP13569 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CFTRP13569 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CFTRP13569 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CFTRP13569 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CFTRP13569 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CFTRP13569 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFTRP13569 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFTRP13569 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFTRP13569 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFTRP13569 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFTRP13569 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFTRP13569 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFTRP13569 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFTRP13569 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFTRP13569 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFTRP13569 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFTRP13569 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFTRP13569 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFTRP13569 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFTRP13569 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFTRP13569 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFTRP13569 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFTRP13569 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFTRP13569 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFTRP13569 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
CFTRP13569 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFTRP13569 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFTRP13569 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFTRP13569 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CFTRP13569 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CFTRP13569 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CFTRP13569 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CFTRP13569 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CFTRP13569 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CFTRP13569 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CFTRP13569 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CFTRP13569 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CFTRP13569 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CFTRP13569 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFTRP13569 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFTRP13569 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CFTRP13569 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFTRP13569 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms