Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXD8P13378 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD8P13378 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms