Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COL11A1P12107 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL11A1P12107 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms