Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFHP12036 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFHP12036 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFHP12036 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFHP12036 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFHP12036 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFHP12036 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFHP12036 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFHP12036 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFHP12036 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFHP12036 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEFHP12036 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFHP12036 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFHP12036 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFHP12036 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFHP12036 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFHP12036 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFHP12036 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFHP12036 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFHP12036 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFHP12036 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFHP12036 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFHP12036 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEFHP12036 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEFHP12036 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEFHP12036 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEFHP12036 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEFHP12036 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEFHP12036 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEFHP12036 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEFHP12036 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEFHP12036 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEFHP12036 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEFHP12036 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEFHP12036 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEFHP12036 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEFHP12036 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEFHP12036 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEFHP12036 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEFHP12036 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFHP12036 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFHP12036 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFHP12036 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFHP12036 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFHP12036 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFHP12036 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFHP12036 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFHP12036 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFHP12036 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFHP12036 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFHP12036 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFHP12036 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFHP12036 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFHP12036 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFHP12036 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFHP12036 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFHP12036 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFHP12036 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFHP12036 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms