Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms