Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA3

SNHG28, Putative uncharacterized protein SNHG28, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28P0DPA3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNHG28P0DPA3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms