Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM6P0DI80 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms