Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA6AP0CW24 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms