Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC4P0CG21 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLRC4P0CG21 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC4P0CG21 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms