Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTAP09496 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTAP09496 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTAP09496 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTAP09496 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTAP09496 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLTAP09496 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTAP09496 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTAP09496 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTAP09496 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTAP09496 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTAP09496 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTAP09496 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTAP09496 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTAP09496 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLTAP09496 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTAP09496 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTAP09496 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTAP09496 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTAP09496 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTAP09496 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTAP09496 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTAP09496 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTAP09496 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTAP09496 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTAP09496 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTAP09496 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTAP09496 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTAP09496 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTAP09496 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTAP09496 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTAP09496 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTAP09496 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTAP09496 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTAP09496 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTAP09496 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTAP09496 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTAP09496 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTAP09496 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTAP09496 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTAP09496 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTAP09496 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTAP09496 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTAP09496 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTAP09496 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms