Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLBP06746 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLBP06746 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLBP06746 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLBP06746 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLBP06746 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLBP06746 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLBP06746 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLBP06746 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLBP06746 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLBP06746 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLBP06746 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLBP06746 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLBP06746 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLBP06746 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLBP06746 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLBP06746 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLBP06746 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLBP06746 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLBP06746 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLBP06746 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLBP06746 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLBP06746 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLBP06746 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLBP06746 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLBP06746 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLBP06746 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLBP06746 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLBP06746 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLBP06746 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLBP06746 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLBP06746 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLBP06746 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLBP06746 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLBP06746 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLBP06746 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLBP06746 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLBP06746 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLBP06746 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLBP06746 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLBP06746 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms