Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA4P06727 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA4P06727 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA4P06727 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA4P06727 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA4P06727 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA4P06727 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA4P06727 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA4P06727 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA4P06727 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA4P06727 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA4P06727 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA4P06727 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA4P06727 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA4P06727 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA4P06727 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA4P06727 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA4P06727 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA4P06727 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA4P06727 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms