Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB1P05937 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB1P05937 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB1P05937 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB1P05937 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB1P05937 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB1P05937 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB1P05937 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB1P05937 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB1P05937 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB1P05937 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB1P05937 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB1P05937 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB1P05937 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB1P05937 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB1P05937 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB1P05937 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB1P05937 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB1P05937 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB1P05937 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB1P05937 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB1P05937 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB1P05937 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB1P05937 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB1P05937 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB1P05937 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB1P05937 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB1P05937 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB1P05937 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB1P05937 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB1P05937 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB1P05937 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB1P05937 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB1P05937 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB1P05937 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALB1P05937 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALB1P05937 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALB1P05937 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALB1P05937 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALB1P05937 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALB1P05937 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALB1P05937 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALB1P05937 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALB1P05937 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALB1P05937 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALB1P05937 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALB1P05937 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALB1P05937 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALB1P05937 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALB1P05937 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALB1P05937 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALB1P05937 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms