Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB2P05107 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB2P05107 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms