Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOC1P02654 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOC1P02654 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC1P02654 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC1P02654 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC1P02654 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC1P02654 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC1P02654 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC1P02654 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC1P02654 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC1P02654 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC1P02654 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC1P02654 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC1P02654 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC1P02654 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC1P02654 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC1P02654 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC1P02654 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC1P02654 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC1P02654 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC1P02654 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC1P02654 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC1P02654 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC1P02654 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC1P02654 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms