Protein–RNA interactions for Protein: P01763

IGHV3-48, Immunoglobulin heavy variable 3-48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-48P01763 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IGHV3-48P01763 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-48P01763 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-48P01763 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-48P01763 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-48P01763 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-48P01763 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-48P01763 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-48P01763 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-48P01763 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms