Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EGFRP00533 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EGFRP00533 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EGFRP00533 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EGFRP00533 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EGFRP00533 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EGFRP00533 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EGFRP00533 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EGFRP00533 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EGFRP00533 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EGFRP00533 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EGFRP00533 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EGFRP00533 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EGFRP00533 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EGFRP00533 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EGFRP00533 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EGFRP00533 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EGFRP00533 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EGFRP00533 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EGFRP00533 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EGFRP00533 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EGFRP00533 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EGFRP00533 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EGFRP00533 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EGFRP00533 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EGFRP00533 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EGFRP00533 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EGFRP00533 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EGFRP00533 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EGFRP00533 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EGFRP00533 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EGFRP00533 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EGFRP00533 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EGFRP00533 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EGFRP00533 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EGFRP00533 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EGFRP00533 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EGFRP00533 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EGFRP00533 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EGFRP00533 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EGFRP00533 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EGFRP00533 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EGFRP00533 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EGFRP00533 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EGFRP00533 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EGFRP00533 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EGFRP00533 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EGFRP00533 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EGFRP00533 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EGFRP00533 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EGFRP00533 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EGFRP00533 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EGFRP00533 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EGFRP00533 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EGFRP00533 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EGFRP00533 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EGFRP00533 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EGFRP00533 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EGFRP00533 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EGFRP00533 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EGFRP00533 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EGFRP00533 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EGFRP00533 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EGFRP00533 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EGFRP00533 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EGFRP00533 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EGFRP00533 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EGFRP00533 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EGFRP00533 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EGFRP00533 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EGFRP00533 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EGFRP00533 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EGFRP00533 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EGFRP00533 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EGFRP00533 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EGFRP00533 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EGFRP00533 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EGFRP00533 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EGFRP00533 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EGFRP00533 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EGFRP00533 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EGFRP00533 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EGFRP00533 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EGFRP00533 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EGFRP00533 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EGFRP00533 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EGFRP00533 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EGFRP00533 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms