Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms