Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX58O95786 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX58O95786 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX58O95786 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX58O95786 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX58O95786 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX58O95786 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX58O95786 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX58O95786 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX58O95786 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX58O95786 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX58O95786 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX58O95786 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX58O95786 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX58O95786 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX58O95786 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DDX58O95786 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX58O95786 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX58O95786 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DDX58O95786 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX58O95786 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX58O95786 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX58O95786 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX58O95786 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX58O95786 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX58O95786 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX58O95786 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX58O95786 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX58O95786 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX58O95786 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX58O95786 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX58O95786 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX58O95786 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX58O95786 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX58O95786 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX58O95786 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX58O95786 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX58O95786 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX58O95786 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX58O95786 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX58O95786 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX58O95786 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX58O95786 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX58O95786 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX58O95786 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DDX58O95786 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX58O95786 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX58O95786 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX58O95786 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX58O95786 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX58O95786 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX58O95786 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX58O95786 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX58O95786 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX58O95786 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX58O95786 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX58O95786 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX58O95786 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX58O95786 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX58O95786 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX58O95786 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX58O95786 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX58O95786 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX58O95786 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX58O95786 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX58O95786 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX58O95786 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX58O95786 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX58O95786 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX58O95786 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX58O95786 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX58O95786 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX58O95786 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX58O95786 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX58O95786 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX58O95786 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX58O95786 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX58O95786 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX58O95786 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX58O95786 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX58O95786 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX58O95786 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX58O95786 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX58O95786 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX58O95786 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX58O95786 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX58O95786 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX58O95786 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms