Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNTO95613 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNTO95613 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNTO95613 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNTO95613 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNTO95613 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNTO95613 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNTO95613 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCNTO95613 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCNTO95613 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCNTO95613 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNTO95613 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNTO95613 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNTO95613 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNTO95613 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNTO95613 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNTO95613 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNTO95613 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNTO95613 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNTO95613 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNTO95613 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNTO95613 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNTO95613 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNTO95613 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNTO95613 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNTO95613 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNTO95613 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNTO95613 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNTO95613 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNTO95613 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNTO95613 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNTO95613 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNTO95613 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNTO95613 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNTO95613 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNTO95613 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNTO95613 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNTO95613 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNTO95613 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNTO95613 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNTO95613 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNTO95613 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNTO95613 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNTO95613 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNTO95613 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNTO95613 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNTO95613 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNTO95613 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNTO95613 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNTO95613 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNTO95613 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNTO95613 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNTO95613 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCNTO95613 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCNTO95613 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms