Protein–RNA interactions for Protein: O94989

ARHGEF15, Rho guanine nucleotide exchange factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF15O94989 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF15O94989 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF15O94989 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF15O94989 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF15O94989 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms