Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM13AO94988 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM13AO94988 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms