Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG12O94817 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG12O94817 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG12O94817 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG12O94817 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG12O94817 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG12O94817 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG12O94817 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG12O94817 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG12O94817 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG12O94817 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG12O94817 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG12O94817 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG12O94817 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG12O94817 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG12O94817 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG12O94817 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG12O94817 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG12O94817 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG12O94817 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG12O94817 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG12O94817 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG12O94817 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG12O94817 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG12O94817 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG12O94817 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG12O94817 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG12O94817 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG12O94817 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG12O94817 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms