Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A2O94788 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms