Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB3O75712 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB3O75712 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB3O75712 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB3O75712 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB3O75712 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB3O75712 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB3O75712 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB3O75712 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB3O75712 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB3O75712 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB3O75712 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB3O75712 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GJB3O75712 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB3O75712 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB3O75712 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB3O75712 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB3O75712 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB3O75712 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB3O75712 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB3O75712 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB3O75712 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB3O75712 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB3O75712 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB3O75712 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB3O75712 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB3O75712 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB3O75712 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB3O75712 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB3O75712 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB3O75712 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB3O75712 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB3O75712 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB3O75712 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB3O75712 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB3O75712 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB3O75712 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB3O75712 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB3O75712 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB3O75712 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB3O75712 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms