Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BANF1O75531 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BANF1O75531 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BANF1O75531 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BANF1O75531 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BANF1O75531 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BANF1O75531 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BANF1O75531 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BANF1O75531 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BANF1O75531 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BANF1O75531 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BANF1O75531 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BANF1O75531 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BANF1O75531 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BANF1O75531 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BANF1O75531 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BANF1O75531 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BANF1O75531 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BANF1O75531 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BANF1O75531 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BANF1O75531 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BANF1O75531 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BANF1O75531 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BANF1O75531 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BANF1O75531 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BANF1O75531 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BANF1O75531 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BANF1O75531 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BANF1O75531 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BANF1O75531 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BANF1O75531 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BANF1O75531 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BANF1O75531 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BANF1O75531 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BANF1O75531 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms