Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL41O60662 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms