Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LY75O60449 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LY75O60449 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LY75O60449 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LY75O60449 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LY75O60449 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LY75O60449 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LY75O60449 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LY75O60449 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LY75O60449 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LY75O60449 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LY75O60449 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LY75O60449 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LY75O60449 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LY75O60449 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LY75O60449 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LY75O60449 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LY75O60449 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LY75O60449 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LY75O60449 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LY75O60449 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY75O60449 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LY75O60449 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LY75O60449 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LY75O60449 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LY75O60449 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LY75O60449 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LY75O60449 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LY75O60449 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LY75O60449 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LY75O60449 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LY75O60449 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LY75O60449 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LY75O60449 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LY75O60449 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LY75O60449 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LY75O60449 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LY75O60449 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LY75O60449 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LY75O60449 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LY75O60449 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LY75O60449 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LY75O60449 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LY75O60449 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LY75O60449 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LY75O60449 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LY75O60449 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LY75O60449 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LY75O60449 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LY75O60449 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LY75O60449 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LY75O60449 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LY75O60449 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LY75O60449 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LY75O60449 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LY75O60449 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LY75O60449 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LY75O60449 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LY75O60449 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LY75O60449 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LY75O60449 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LY75O60449 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LY75O60449 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms