Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PPLO60437 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PPLO60437 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PPLO60437 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PPLO60437 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPLO60437 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PPLO60437 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPLO60437 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPLO60437 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPLO60437 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPLO60437 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPLO60437 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPLO60437 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPLO60437 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPLO60437 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPLO60437 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PPLO60437 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PPLO60437 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PPLO60437 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPLO60437 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPLO60437 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPLO60437 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPLO60437 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPLO60437 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPLO60437 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPLO60437 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPLO60437 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PPLO60437 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPLO60437 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPLO60437 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PPLO60437 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PPLO60437 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPLO60437 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PPLO60437 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PPLO60437 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PPLO60437 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PPLO60437 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PPLO60437 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PPLO60437 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PPLO60437 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PPLO60437 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PPLO60437 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PPLO60437 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PPLO60437 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PPLO60437 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPLO60437 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPLO60437 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPLO60437 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPLO60437 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPLO60437 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PPLO60437 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPLO60437 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPLO60437 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPLO60437 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPLO60437 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPLO60437 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPLO60437 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPLO60437 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPLO60437 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPLO60437 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPLO60437 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPLO60437 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPLO60437 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PPLO60437 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PPLO60437 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PPLO60437 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPLO60437 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPLO60437 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPLO60437 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PPLO60437 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPLO60437 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPLO60437 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPLO60437 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPLO60437 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms