Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms