Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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VEGFDO43915 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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VEGFDO43915 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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VEGFDO43915 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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VEGFDO43915 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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VEGFDO43915 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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VEGFDO43915 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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VEGFDO43915 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VEGFDO43915 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VEGFDO43915 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VEGFDO43915 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VEGFDO43915 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VEGFDO43915 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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