Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDIL3O43854 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDIL3O43854 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms