Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGTAO43765 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SGTAO43765 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGTAO43765 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGTAO43765 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGTAO43765 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGTAO43765 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGTAO43765 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGTAO43765 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SGTAO43765 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGTAO43765 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SGTAO43765 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGTAO43765 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGTAO43765 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGTAO43765 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SGTAO43765 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGTAO43765 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGTAO43765 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGTAO43765 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGTAO43765 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGTAO43765 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGTAO43765 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGTAO43765 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGTAO43765 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGTAO43765 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGTAO43765 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGTAO43765 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGTAO43765 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGTAO43765 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGTAO43765 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGTAO43765 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGTAO43765 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SGTAO43765 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGTAO43765 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGTAO43765 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGTAO43765 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGTAO43765 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGTAO43765 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGTAO43765 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGTAO43765 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGTAO43765 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGTAO43765 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SGTAO43765 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGTAO43765 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGTAO43765 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGTAO43765 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGTAO43765 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGTAO43765 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGTAO43765 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGTAO43765 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGTAO43765 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTAO43765 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTAO43765 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms