Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ3O43525 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms