Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXO3O43524 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FOXO3O43524 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO3O43524 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO3O43524 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO3O43524 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO3O43524 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO3O43524 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO3O43524 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO3O43524 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO3O43524 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO3O43524 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms