Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms