Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms