Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms