Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHADO15335 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHADO15335 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHADO15335 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHADO15335 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHADO15335 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHADO15335 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHADO15335 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHADO15335 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHADO15335 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHADO15335 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHADO15335 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHADO15335 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHADO15335 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms