Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARPC1BO15143 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms