Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHUKO15111 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHUKO15111 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHUKO15111 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHUKO15111 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHUKO15111 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHUKO15111 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHUKO15111 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHUKO15111 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHUKO15111 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHUKO15111 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHUKO15111 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHUKO15111 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHUKO15111 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHUKO15111 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHUKO15111 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHUKO15111 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHUKO15111 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHUKO15111 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHUKO15111 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHUKO15111 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHUKO15111 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHUKO15111 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHUKO15111 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHUKO15111 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHUKO15111 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHUKO15111 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHUKO15111 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHUKO15111 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHUKO15111 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHUKO15111 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHUKO15111 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHUKO15111 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHUKO15111 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHUKO15111 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHUKO15111 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHUKO15111 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHUKO15111 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHUKO15111 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHUKO15111 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHUKO15111 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHUKO15111 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms